Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC117Q8IWD4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms