Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms