Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEND4Q6ZU67 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms