Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H3F3CQ6NXT2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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