Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL6Q6ICC9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms