Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF20Q5VT98 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms