Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT6Q5T7P8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT6Q5T7P8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms