Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms