Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms