Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms