Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms