Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms