Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KNOP1Q1ED39 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNOP1Q1ED39 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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