Protein–RNA interactions for Protein: Q17RC7

EXOC3L4, Exocyst complex component 3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOC3L4Q17RC7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOC3L4Q17RC7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOC3L4Q17RC7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOC3L4Q17RC7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOC3L4Q17RC7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOC3L4Q17RC7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOC3L4Q17RC7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOC3L4Q17RC7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOC3L4Q17RC7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOC3L4Q17RC7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOC3L4Q17RC7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOC3L4Q17RC7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOC3L4Q17RC7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms