Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFA9Q16795 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFA9Q16795 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms