Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIST3H3Q16695 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms