Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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