Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FXNQ16595 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FXNQ16595 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FXNQ16595 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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