Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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SGCAQ16586 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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SGCAQ16586 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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SGCAQ16586 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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SGCAQ16586 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SGCAQ16586 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SGCAQ16586 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SGCAQ16586 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SGCAQ16586 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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SGCAQ16586 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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SGCAQ16586 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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