Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SNAPC1Q16533 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SNAPC1Q16533 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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SNAPC1Q16533 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SNAPC1Q16533 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SNAPC1Q16533 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SNAPC1Q16533 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SNAPC1Q16533 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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