Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F4Q16254 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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