Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms