Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms