Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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