Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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SIX1Q15475 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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SIX1Q15475 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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