Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRRQ15256 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms