Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAM2Q15035 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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