Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
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