Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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GBX1Q14549 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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GBX1Q14549 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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GBX1Q14549 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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GBX1Q14549 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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GBX1Q14549 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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GBX1Q14549 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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GBX1Q14549 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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GBX1Q14549 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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GBX1Q14549 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBX1Q14549 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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