Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms