Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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SPIDRQ14159 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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SPIDRQ14159 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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SPIDRQ14159 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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SPIDRQ14159 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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SPIDRQ14159 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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SPIDRQ14159 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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SPIDRQ14159 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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SPIDRQ14159 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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SPIDRQ14159 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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SPIDRQ14159 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIDRQ14159 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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