Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3AQ14156 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms