Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRQ13535 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRQ13535 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRQ13535 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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