Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTB2Q13425 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTB2Q13425 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTB2Q13425 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTB2Q13425 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTB2Q13425 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTB2Q13425 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTB2Q13425 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTB2Q13425 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTB2Q13425 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTB2Q13425 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNTB2Q13425 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTB2Q13425 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms