Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
AP3B2Q13367 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP3B2Q13367 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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