Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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SEMA3BQ13214 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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SEMA3BQ13214 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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SEMA3BQ13214 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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