Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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