Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1AQ13111 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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