Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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