Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms