Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK1Q08629 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms