Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms