Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms