Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEUP1Q05D60 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms