Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLE4Q04727 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms