Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms