Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DSG1Q02413 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms