Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSF1Q00613 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms