Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX1P83916 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX1P83916 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX1P83916 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX1P83916 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX1P83916 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX1P83916 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX1P83916 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX1P83916 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX1P83916 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX1P83916 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX1P83916 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX1P83916 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX1P83916 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX1P83916 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX1P83916 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX1P83916 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX1P83916 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX1P83916 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX1P83916 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX1P83916 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX1P83916 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX1P83916 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX1P83916 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX1P83916 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX1P83916 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX1P83916 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX1P83916 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX1P83916 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX1P83916 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX1P83916 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX1P83916 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX1P83916 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX1P83916 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX1P83916 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms