Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIM1P81133 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIM1P81133 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIM1P81133 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SIM1P81133 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIM1P81133 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIM1P81133 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIM1P81133 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIM1P81133 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIM1P81133 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIM1P81133 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIM1P81133 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIM1P81133 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIM1P81133 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIM1P81133 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIM1P81133 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIM1P81133 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SIM1P81133 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SIM1P81133 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIM1P81133 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIM1P81133 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIM1P81133 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIM1P81133 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIM1P81133 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SIM1P81133 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms